2010年8月
，中国科学院昆明植物研究所植物种质资源与基因组学研究中心中科院“百人妄想”和云南省首届高端科技人才入选者高立志研究员向导的植物种质资源、基因组学与生物信息学团队
，历时一年
，运用新一代高通量测序手艺以及基于高性能超算的生物信息学剖析
，对野生稻全基因组测序取得了阶段性重大效果
。日前已经完成了通俗野生稻基因组高笼罩的序列测定、拼接和组装事情
，获得了通俗野生稻全基因组重新测序的框架图
，基因组图谱已抵达国际领先的基因组图谱标准
。这是我国科学家自主完成的第一个野生稻全基因组测序妄想
，也是天下上第一个完成的高杂合度野生稻全基因组框架图谱
。

　　本项目的完成主要依托于2009年底顺遂通过了国家验收的国家大科学工程中国西南野生生物种质资源库先进的基因组学与生物信息学平台
。测序事情主要由第二代高通量测序仪Solexa GA II完成
，生物信息学剖析则依托于种质资源库建成的“中国科学院超算中心西南分中心”10万亿次/秒的盘算能力、512 GB的大内存节点和100 TB存储的超算平台
。通俗野生稻全基因组是使用高通量、低本钱的第二代Solexa测序手艺对差别长度的shotgun文库测序
，辅以构建较长片断文库的454测序手艺；项目还用454测序手艺完成了多个组织转录组的测序事情
，为基因组的准确注释提供参考
。研究批注
，通俗野生稻的基因组巨细约为3.70亿个碱基对
，含有的基因总数目约为4.0万个
，测序深度已达基因组巨细的70倍
，测序效果已笼罩92%的通俗野生稻全基因组
，基因笼罩度约为90%以上
。现在
，项目组正在加紧绘制通俗野生稻的基因组细腻图谱
。

　　该项目的完成获得了云南省自然科学基金重点项目、云南省高端科技人才项目、中国科学院“百人妄想”外洋优异人才择优支持项目和中科院偏向性重点项目的鼎力大举支持
。云南是亚洲莳植稻的遗传多样性中心之一
，云南通俗野生稻全基因组框架图的完成
，将大大增进云南野生稻资源的研究与掘客使用
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