《自然一要领学》网络版克日先容了瑞典苏黎世大学生命科学研究所迈克尔.恩加特纳(Michael O Hengartner)研究组发明的一种大标准判断miRNA靶点新要领。
在已往几年中,随着实验和盘算要领的生长和完善,miRNA靶点的判断和展望研究取得很大希望。然而,周全准确的判断miRNA的生物学相关靶点依然是个难点。恩加特纳研究组发明了一种叫做“选择性反应监测”(seleted reaction montitoring,SRM)的要领,该要领使用有针对性的质谱手艺实现了对miRNA靶点互作的大标准卵白组学剖析,进而对展望的靶点举行验证。
恩加特纳等人使用线虫let-7突变体及其野生型为实验质料。为了测定于let-7突变数目镌汰致的卵白含量的下降,恩加特纳等人对感兴趣的let-7突变体和野生型的卵白提取物举行化学标记,之后一套比照基因。效果发明,161个卵白中的29个卵白的表达含量在突变体中爆发转变,这可能是由于let-7基因和差别的靶点互作效果--该效果获得了自力下游试验包括遗传互作、多聚核糖剖析和荧光霉素磨练的验证。
SRM手艺可以作为一个验证工具来进一步探索关于靶点的明确;别的,SRM也可能用来细腻形貌目的卵白质组亚群,增进miRNA生物功效模子的研究。