来自南开大学生命科学学院,香港大学等处的研究职员针对一种要害碱性核酸外切酶,剖析了其生化,及生物物理特征,发明了这种酶的要害作用机制,这关于进一步剖析DNA重组和修复具有主要意义。这一研究效果宣布在Nucleic Acids Research杂志上。碱性核酸外切酶,以及单链DNA(ssDNA)消化卵白(SSAPs)是许多原核生物,噬菌体,以及病毒状遗传元素中,DNA重组和修复系统的主要组成因素。从近期完成的β-变形菌纲(β-proteobacterium)香港海鸥型菌(Laribacter hongkongensis)HLHK9菌株的基因组序列中,研究职员发明这一3.17Mb巨细的基因组有编码碱性核酸外切酶(LHK-Exo)和SSAP (LHK-Bet) 可能同源异构体。
为了剖析这些要害元素的特征,在这篇文章中,研究职员剖析了LHK-Exo重组卵白的生物物理,生物化学,及结构上的特征,并通过结构导向突变剖析,探讨了其中差别残基的活性,指出两个守旧性金属离子催化机制也许是这种碱性核酸外切酶的要害所在。
LHK-Exo能消化线性双链DNA剖析,这种外切酶特征需要pH8.2的碱性情形,以及Mg2+或者Mn2+金属离子。研究职员获得了LHK-Exo晶体结构(区分率1.9),并从中剖析LHK-Exo的特征,以及要害作用机制,这关于进一步剖析DNA重组和修复具有主要意义。除此之外,南开大学的研究职员还发文叙述和探讨了诺罗病毒与Lewis型人类组织血型抗原受体(HBGAs)团结特异性的结构基础与分子机制。这一研究成宣布在PLoS Pathogens杂志上。
研究职员凭证诺罗病毒VA207衣壳卵白P结构域与Lewis四糖的复合物晶体结构发明,识别四糖的活性位点位于卵白二聚体作用界面的口袋中,卵白和四糖分子之间具有稳固而普遍的氢键网络系统,加入卵白-寡糖相互作用的残基在诺罗病毒家族中具有较高的同源性,且作用模式属于典范的诺罗病毒G-II型基因族的作用模式。突变实验和卵白-寡糖作用检测实验效果证实,加入该作用的氨基酸残基关于病毒与宿主的相互识别作用具有主要意义,对该残基的突变将导致与原来HBGAs寡糖分子团结能力的损失并使其具有识别新的HBGAs寡糖分子的能力。这项研究通过对诺罗病毒衣壳卵白与lewis寡糖复合物的结构和功效研究,有助于对诺罗病毒与HBGAs的识别作用和侵染宿主提供周全、合理的结构诠释,同时为研发抗诺罗病毒药物提供主要的科学依据。