含400种差别物种及24种肠道微生物“暗物种”

肠道微生物与宿主康健和生长发育亲近相关。微生物所供图

克日，中科院微生物所研究员刘双江团队构建了包括400个差别物种的康健人群肠道微生物菌株资源库（hGMB），相关效果揭晓于《微生物组》期刊。

越来越多的证据批注，肠道微生物与宿主康健和生长发育亲近相关。现在，仅有缺乏半数的肠道微生物物种，乐成地在实验室获得纯作育和命名。肠道微生物菌株资源的匮乏，极大的限制了肠道微生物的应用与研究。

此次他与团队构建的hGMB包括400个差别的物种，其中有102个物种为首次疏散、作育和判断，1170株代表性菌株生涯在中国通俗微生物菌种收藏中心，已经向科研界和工业界提供了数次菌株服务，支持肠道微生物功效开发和微生物-宿主互作的研究。为了充分验展和挖掘菌株资源的价值，该资源库物种信息已在网站（hgmb.nmdc.cn）宣布。

据先容，hGMB的构建历时两年，研究团队从239例来自差别地区和差别年岁的体检康健人群的新鲜粪便样品中挑取凌驾2万个单克隆，扩着述育后从中判断出凌驾1万个纯作育疏散株。通过对康健人肠道宏基因组剖析，发明该菌株资源库中的85个新物种泛起在凌驾90%康健人肠道中，同时笼罩79%人肠道已知常见属和75%常见物种。

与现在最大的人肠道基因组数据库（UHGG）比照，hGMB孝顺了24个在肠道免作育组学研究中未被探测到却普遍保存的“暗物种”。

作者体现，鉴于肠道微生物菌株资源库的建设是开发使用肠道微生物的基础，是认知宿主—微生物互作机制中至关主要的一环，构建中华肠道微生物资源库具有久远的战略意义和经济社会价值。

去年，该团队还揭晓了迄今为止最大的模式动物小鼠肠道微生物资源库（mGMB），包括126种微生物及其基因组，其中77种微生物是首次乐成疏散作育的新物种，使得可作育的小鼠肠道微生物菌株资源从48个属增添到110个属、从76种增添到180种，且在此历程中形成了一套厌氧微生物疏散作育与物种判断形貌的最简标准化流程。

相关论文信息：https://doi.org/10.1186/s40168-021-01064-3