
2017年9月18日,由国际半干旱地区热带作物研究所(ICRISAT)主导,深圳华大生命科学研究院(原:深圳华大基因研究院)、青岛华大基因研究院、深圳国家基因库(CNGB)、法国研究与生长研究所(IRD)、美国乔治亚大学、德国植物遗传和作物研究所(IPK)等33家科研单位配合相助完成的珍珠粟基因组研究最新研究效果揭晓于国际著名杂志《自然-生物手艺》(Nature Biotechnology)。该科研团队乐成构建了珍珠粟全基因组序列,并从基因组结构、群体进化、物种性状关联剖析等角度周全解读珍珠粟基因组,为农作物的科学研究、改善珍珠粟干旱情形下的农艺性状提供遗传资源。
珍珠粟项目为国际相助项目,获得了比尔和梅琳达·盖茨基金会的鼎力大举支持。在该项目中,华大加入整体项目设计,配合监视科研事情的推进。别的,华大肩负全基因组二代测序及重测序样品的二代测序使命,认真基因组的组装、注释、基因家族与进化等基因组学方面的剖析研究,对九百多个重测序样本举行变异检测,并与法国研究与生长研究所(IRD)的先生相助剖析珍珠粟的群体多样性及其驯化历史。
珍珠粟属于禾本科黍亚科,是一种高度异花授粉的二倍体C4植物(2n=2x=14),具有很是高的光相助用效率和潜在生物量能产出。现在,珍珠粟的莳植主要漫衍在非洲撒哈拉沙漠以南、印度及南亚等地区,是这些地区农民的主要食物泉源。这些地区土壤肥力较低、土壤水分含量少且pH值盐度高,同时伴有高温、有限降水等卑劣情形,在这样的条件下,玉米、水稻、高粱、小麦等作物都无法普遍莳植。珍珠粟却能很好地顺应这样的干旱情形,在平均年降水量低至250毫米的地区仍可以生产粮食。
该研究接纳二代测序手艺,对珍珠粟全基因组DNA举行了测序、组装,并通过构建遗传图谱将全基因组序列连成7条染色体。研究职员通过群体多样性的较量剖析判断了莳植品种在驯化历程的受选择区域以及这些区域中携带野生种与莳植种表型差别和形态爆发相关的基因,为以后珍珠粟的驯化剖析、表型/基因型关联研究提供了更详细的线索。
国际半干旱地区热带作物研究所所长David Bergvinson博士体现这项研究将为非洲和亚洲较量边沿的农业地区带来高产量珍珠粟的莳植商业。另外,找到珍珠粟耐热性更好的基因也将有助于推动增强其他作物如小麦、水稻和玉米的耐热性的研究。同时,此项目也证实晰投资所谓的“孤生作物”或被忽视的作物的主要性。
随着全球温度的升高,下个世纪迫切需要耐热耐旱的农作物。该论文的通讯作者、深圳华大生命科学研究院院长、深圳国家基因库执行主任徐讯体现,珍珠粟在印非地区是很是主要的粮食作物,其基因组研究对珍珠粟的遗传育种、农艺性状改善有起劲作用。不但云云,针对珍珠粟能做的事情,也将可以拓展到所有的外地作物,这对支援印非半干旱地区其他农作物的莳植开发有着主要的意义。